Các gen ở vi khuẩn E. coli được khởi động phiên mã nhờ ARN polymerase nhận biết và liên kết vào các hộp -10 (5'-TATAAT-3') và -35 (5'-TTGACA-3') trong vùng khởi động của gen. Một gen có sản phẩm phiên mã chứa 2 nucleotit đầu tiên là 5'-AG-3', đồng thời có trình tự vùng khởi động như sau:

Do mỗi mạch của phân tử ADN sợi kép đều có thể làm khuôn phiên mã, nên sự phiên mã có thể diễn ra theo một trong hai chiều 1 hoặc 2 như ở hình trên. Cho các phát biểu sau:
1. Điểm khởi đầu phiên mã và các hộp -10 và -35 tương ứng sẽ có 2 vị trí nucleotit.
2. Chiều phiên mã với trình tự khởi động nêu trên theo chiều 1.
3. Mạch trình tự 5'→ 3' ở trên là mạch làm mạch mã hóa.
4. Vị trí khởi động phiên mã là vị trí số 6.
Số phát biểu đúng là:

Lời giải chi tiết (trang 10) kết luận "Đáp án C":
1. Đúng, Điểm khởi động phiên mã sẽ là vị trí A trong cặp nucleotit 5'-AG-3' của mạch mã hóa cách ngược dòng khoảng 10 nucleotit tới hộp 5'-TATAAT-3' và khoảng 35 nucleotit tới hộp 5'-TTGACA-3' trên mạch mã hóa; Hoặc vị trí C trong cặp nucleotit 5'-CT-3' cách xuôi dòng khoảng 10 nucleotit tới hộp 5'-ATTATA-3' và khoảng 35 nucleotit tới hộp 5'-TGTCAA-3' trên mạch làm khuôn (theo nguyên tắc bổ sung)
→ Từ trình tự trên có thể nhận thấy Vị trí khởi động phiên mã là vị trí số 6; hộp -10 từ vị trí 14 đến vị trí 19; hộp -35 từ vị trí 38 đến vị trí 43 → 4 Đúng
2. Sai, Theo chiều 2, vì các hộp -10 và -35 nằm phía phải (nhìn từ ngoài vào) so với vị trí khởi đầu phiên mã
3. Sai, Mạch trình tự ở trên là mạch làm khuôn phiên mã, như đã được giải thích ở ý 1
Lưu ý: Bảng đáp án chính thức ở trang 8 ghi Câu 116 là D, trong khi lời giải chi tiết kết luận C → đáp án xung đột, để unknown.