Ở ruồi giấm A qui định mắt đỏ là trội hoàn toàn so với a qui định mắt trắng. Cho các cá thể ruồi giấm đực và cái có 5 kiểu gen khác nhau giao phối tự do (số lượng cá thể ở mỗi kiểu gen là như nhau). Tỉ lệ phân li kiểu hình ở đời lai là:

$X^A{X}^a,X^A{X}^A,X^a{X}^a,X^{a}Y,X^{A}Y$ : 5 kiểu gen do đó gen nằm trên nhiễm sắc thể giới tính X không alen tương ứng trên Y.
Vì số lượng cá thể ở mỗi kiểu gen là như nhau nên P: $\frac{1}{5}{X}^A{X}^A,\frac{1}{5}{X}^A{X}^a,\frac{1}{5}{X}^a{X}^a,\frac{1}{5}{X}^{a}Y,\frac{1}{5}{X}^{A}Y$
Từ đó suy ra $X^A=x^a=0,5$ (xét ở giới đực tỉ lệ 2 KG bằng nhau nên tỉ lệ 2 alen A và a cũng bằng nhau và bằng 0,5)
Suy ra giới đực $0,5X^{A}Y:0,5X^{a}Y=1$
Giới cái: (0,5 X^A: 0,5X^a) (0,5 X^A: 0,5X^a)= 0,25 X^A X^A: 0,5 X^A X^a : 0,25 X^a X^a.
Các cá thể giao phối tự do ta có: 0,125 X^A X^A: 0,25 X^A X^a : 0,125 X^a X^a : 0,25 X^a Y : 0,25 X^A Y=1
Mặt đỏ= 0,125+ 0,25+ 0,25= 0,625= 62,5%.